L’IHEST est placé sous la tutelle des ministres chargés de l’Education, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche. Conformément au besoin identifié de refonder le rapport de confiance entre la société et la science, l’IHEST est investi d’une mission dont les trois dimensions sont : la formation ; la diffusion de la culture scientifique dans la société et une animation du débat public autour du progrès scientifique et technologique et de son impact sur la société.