Le Conseil scientifique, présidé par Bertrand COLLOMB, est composé de douze à vingt personnalités désignés par les ministères chargés de l’éducation, de l’enseignement supérieur et de la recherche en raison de leur compétence.
Composition du Conseil scientifique en mai 2008 :
| Richard ARMAND | Entreprises pour l’Environnement |
| Jean-Michel BESNIER | Université Paris 4 |
| Jean-Pierre BOURGUIGNON | Institut des Hautes Etudes Scientifiques |
| Monique CAPRON | Inserm, Institut Pasteur de Lille |
| Antoine COMPAGNON | Collège de France |
| Christian de BOISSIEU | Conseil d’Analyse Economique |
| François EWALD | Conservatoire national des arts et métiers |
| Olivier FARON | ENS-Lettres et Sciences Humaines |
| Jean-François GIRARD | Institut de Recherche pour le Développement |
| Alain JUILLET | Secrétariat Général de la Défense Nationale |
| Étienne KLEIN | CEA |
| Jacques LECLAIRE | L’Oréal |
| Patrick MAESTRO | RHODIA |
| Guy PAILLOTIN | Académie d’agriculture de France |
| Gunter PLEUGER | Président de l’université Viadrina |
| Jean-Didier VINCENT | Académie des sciences |
| Heinz WISMANN | Ecole des hautes études en sciences sociales |
